Week 22 30/05/2022 - 03/06/2022

To do

In silico

I. Gene regulatory network

• Travailler sur les algorithmes de gene regulatory network
  • Retrouver le papier réunissant différents algo de GRN
  • En installer et tester 1 ou 2

In vitro

• Manip ATAC-seq
• [3/3] Passage

Mai/juin 2022

• Faire le résumé des résultats in vitro et définir les expérimentations in vitro futures (ATACseq, protéomique, CYTOF avec des lignées IDH +/- mIDHi)

In biblio

• Lire “A cellular hierarchy framework for understanding heterogeneity and predicting drug response in AML”
• Lire le papier sur les différents algo de GRN
• Regarder la conf de Andrea Reu

To do

• Planning de la semaine
• Lecture du proto ATAC-seq
• Exp ATAC-seq
• Faire le résumé des résultats in vitro
• Lire “A cellular hierarchy framework for understanding heterogeneity and predicting drug response in AML”
• Regarder la conf de Andrea Reu
• Travailler sur les algorithmes de gene regulatory network
• Réunion ATAC-seq
• Travailler sur les algorithmes de gene regulatory network
• Meeting
• Définir les expérimentations in vitro futures
• Définir les expérimentations in vitro futures