Week 18 . 02/05 - 06/05

TODO

• #Biblio Lire “Aggregated network centrality sgows non-random structure of genomic an proteomic networks”
• #Manips (FACS / culots Prot)
• #ARACNe Comparer les réseaux ARACNe
• #Chromatine Analyser les réseaux Pchic par type cellulaore avec Chaser
• #PPT Préparer un ppt pour groupe de travail bioinfo
• #Mails Voir équipements infos (pour semaine prochaine)
• #Protocole Préparer le protocole pour Mardi

Chromatine

• Ajouter valeurs de randomisation au plot
• Faire dame analyse mais avec donnée de méthylation

Objectif :

Voir quelle lignée cellulaire a montre une assortativité la plus élevée basée sur l’expression génique

DONE

• Plot Chas par phenotype et Cell type
• Plot Chas randomisé par phenotype et Cell type
• Plot combiné

ARACNe

Manips

Protocoles

Biblio

PPT

Lundi 2 mai

• 10h - 10h50 : #Chromatine
• 11h - 11h50 : #Chromatine
• 12h - 12h50 : Déj
• 13h - 13h50 : #Chromatine
• 14h - 14h 50 : #Protocole
• 15h30 - 16h30 : Culture
• 16h30 - 17h : Mails

Mardi 3 mai

• 10h - 12h : #Protocole + #Chromatine
• 13h - 16h : FACS
• 16h - 17h : Analyse résultats FACS